NSCLC患者尿液中游离miRNAs qPCR内参基因的选择

• 作者: 吕中伟 易婉婉 贾成友 郁霞青 钟鹏 陈志刚
• 来源期刊: 同济大学学报（医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 非小细胞肺癌 尿液 游离miRNA qPCR 内参基因
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 419-424
• 页数: 6页
• 分类号: R446.12+2
• 字数: 3930字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16118/j.1008-0392.2019.04.005

摘要

目的 探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者和健康志愿者尿液中微小RNA(miRNA)内参基因的稳定性.方法 分别收集NSCLC患者(12名)和健康志愿者(7名)尿液样本,经膜浓缩过滤后提取其中的总RNA.通过BGISEQ-500 miRNA建库和二代测序技术(NGS)测定尿液样本中miRNA的表达谱,基于测序表达量(transcript per million,TPM)值筛选出前5个高丰度的候选内参基因,包括常用的内参基因U6,通过实时荧光定量PCR (qPCR)技术在另一组样本中进行验证.利用geNorm软件、NormFinder软件和BestKeeper软件评价候选内参基因表达的稳定性.结果 geNorm软件和NormFinder软件分析结果一致,候选内参基因的稳定性由高到低的顺序为:真核生物核糖体大亚基(28S rRNA)、真核生物核糖体小亚基(18S rRNA)、U6、5S rRNA和tRNA.BestKeeper软件分析结果显示28S rRNA和U6的稳定性优于其它候选内参基因,tRNA的表达不稳定,18S rRNA最适合与其它候选内参基因联合使用.结论 28S rRNA是最稳定的内参基因,28S rRNA和18S rRNA可联合使用作为尿液样本中qPCR的内参基因;这为尿液中游离miRNAs在疾病诊断中的定量分析提供了重要依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕中伟	同济大学附属第十人民医院核医学科	65	159	6.0	9.0
2	易婉婉	同济大学附属第十人民医院核医学科	2	6	1.0	2.0
3	陈志刚	同济大学附属上海市肺科医院呼吸科	5	11	2.0	3.0
4	郁霞青	同济大学附属第十人民医院核医学科	4	2	1.0	1.0
5	钟鹏	同济大学附属第十人民医院核医学科	1	0	0.0	0.0
6	贾成友	同济大学附属第十人民医院核医学科	1	0	0.0	0.0