尿素和二甲基亚砜诱导DhaA变性的分子动力学模拟

• 作者: 周健 崔燕 杨盛江 郑永超 郑禾 郭旋 钟近艺
• 来源期刊: 化工学报
• 关键词: 蛋白质变性 尿素 二甲基亚砜 分子动力学模拟
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 生物化学工程与技术
• 页码范围: 4337-4345,封4
• 页数: 10页
• 分类号: O629.73|Q518.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.11949/0438-1157.20190278

摘要

DhaA能够有效降解化学毒剂芥子气,而环境耐受性差影响了其在军事洗消中的应用.虽然已有研究表明定向进化、化学修饰、固定化有利于提高DhaA在尿素、二甲基亚砜(DMSO)溶液中的稳定性,但DhaA在尿素、DMSO下的变性过程尚不清晰.利用分子动力学(MD)模拟方法研究了DhaA在尿素和DMSO两种体系中的变性过程,结果表明尿素分子通过取代水分子与DhaA形成氢键的方式诱导其变性,并且能够与催化位点形成氢键,造成DhaA底物进出口通道长度增加、通道曲率增大、瓶颈尺寸减小;DMSO分子通过范德华作用进入DhaA疏水空腔,从而诱导DhaA变性,使得DhaA通道长度缩短、瓶颈尺寸增大,造成DhaA发生构象变化.该研究结果揭示了DhaA在两种体系中变性过程的区别,能够为DhaA的进一步稳定化提供理论指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周健	华南理工大学化学与化工学院	29	154	7.0	11.0
2	钟近艺		9	11	2.0	3.0
3	崔燕		4	6	2.0	2.0
4	郑禾		2	2	1.0	1.0
5	杨盛江	华南理工大学化学与化工学院	1	0	0.0	0.0
6	郑永超		3	0	0.0	0.0
7	郭旋		1	0	0.0	0.0