玉米(Zea mays)生产上利用的是杂交种,利用不同遗传背景的测交群体来定位杂种当代控制品质性状的遗传位点,是对前人定位研究的有益补充.本实验以100份遗传背景丰富的玉米骨干自交系作为母本,分别以Mo17、E28、昌7-2、郑58作为测验种,按照NCⅡ设计,组配400份杂交组合,构建4个F1群体,每个F1群体各100份杂交组合.对4个测交群体的籽粒品质相关性状进行统计分析和全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).研究结果表明,蛋白质含量在E28和昌7-2测交群体显著高于其他群体(P<0.05);油分含量在E28测交群体显著高于其他群体(P<0.05);赖氨酸含量在Mo17测交群体显著高于其他群体(P<0.05).Mo17测交群体在蛋白质含量、油分含量、赖氨酸含量中分别定位到2、5、17个显著关联的SNP位点,E28测交群体在蛋白质含量、油分含量、赖氨酸含量中分别定位到11、7、54个SNP位点,昌7-2测交群体在蛋白质含量、油分含量、赖氨酸含量中分别定位到8、8、6个SNP位点,郑58测交群体在蛋白质含量、油分含量、赖氨酸含量中分别定位到38、79、11个SNP位点.4个测交群体的定位结果差异很大,对4个测交群体的同一性状SNP位点进行比较,仅得到7个共位点.分别在蛋白质含量、油分含量、赖氨酸含量中定位到2、4、1个共位点,共挖掘到6个候选基因.本研究结果为玉米品质相关性状的传统连锁分析和关联分析提供了有益补充,为进一步玉米籽粒品质改良提供了参考.