赛黑桦matK基因生物信息学分析

• 作者: 周立平 姚殿国 林琳 穆怀志 许建闻 高宇婷
• 来源期刊: 北华大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 赛黑桦 matK基因 生物信息学 系统进化树
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 长白山资源与环境
• 页码范围: 33-37
• 页数: 5页
• 分类号: S718.46
• 字数: 2415字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11713/j.issn.1009-4822.2019.01.006

摘要

matK基因广泛应用于植物亲缘关系和物种鉴定研究.利用生物信息学对赛黑桦matK基因进行开放阅读框、氨基酸组成、蛋白质跨膜结构区、亚细胞定位和结合区分析,预测信号肽、氨基酸亲/疏水性、氨基酸二级结构,利用同源建模构建赛黑桦成熟酶K的三维结构及12种桦木属植物的系统进化树.结果表明:赛黑桦matK基因序列长度为2524 bp,有13个开放阅读框;matK基因编码的成熟酶K含20种氨基酸,由17.86％的α螺旋、9.52％的β折叠和72.62％的无规则卷曲组成,为亲水性蛋白,具有10个蛋白结合区和1个多核苷酸结合区;赛黑桦与白桦、真桦、沼桦、甸生桦、绒毛桦和垂枝桦的亲缘关系较近.研究结果可为赛黑桦苗期的分子鉴定提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林琳	北华大学林学院	20	14	2.0	3.0
2	高宇婷	北华大学林学院	2	1	1.0	1.0
3	穆怀志	北华大学林学院	12	23	3.0	4.0