用于海洋沉积物中厌氧氨氧化细菌分子生态学研究的引物比较

• 作者: 付璐璐 李思琦 甄毓 米铁柱
• 来源期刊: 中国海洋大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 厌氧氨氧化细菌 16SrRNA基因 群落结构 丰度
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 77-88
• 页数: 12页
• 分类号: Q93-3
• 字数: 8627字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16441/j.cnki.hdxb.20180094

摘要

为比较厌氧氨氧化细菌16S rRNA基因的2对特异性引物(Amx368F/Amx820R、Brod541F/Amx820R)在其分子生态学研究方面的优点与不足,本研究采用高通量测序和qPCR技术对长江口及其邻近海域沉积物中厌氧氨氧化细菌细菌的群落组成、多样性和丰度进行比较分析,结果表明,引物Amx368F/Amx820R特异性较高,能够较为完整地反映沉积物中厌氧氨氧化细菌的多样性信息,且其覆盖的厌氧氨氧化细菌丰度与功能基因hzo丰度正相关(P＜0.01);而引物Brod541F/Amx820R特异性较低,覆盖部分厌氧氨氧化细菌及其他多个门的细菌,其量化的厌氧氨氧化细菌与功能基因hzo丰度无明显相关关系(P＞0.05).因此,引物Amx368F/Amx820R能够更加真实地反映厌氧氨氧化细菌在海洋沉积物中的群落特征,在其分子生态学研究中更具优势.