黑须污蝇不同发育阶段转录组及嗅觉相关基因分析

• 作者: 乌云高娃 包花尔 崔阿拉腾乌拉 巴音吉日嘎拉 王超 额尔敦木图
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑须污蝇 转录组 高通量测序 生物信息学分析 荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 生理与生化
• 页码范围: 685-693
• 页数: 9页
• 分类号: Q966
• 字数: 7301字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16380/j.kcxb.2019.06.004

摘要

[目的]建立黑须污蝇Wohlfahrtia magnifica转录组数据库,挖掘黑须污蝇基因数据,为更深入地研究双峰驼阴道蝇蛆病提供理论依据.[方法]采用高通量测序平台Illumina HiseqTM4000对黑须污蝇幼虫、蛹和成虫进行转录组测序,并进行生物信息学分析.利用黑须污蝇幼虫、蛹和成虫转录组数据,通过基因差异表达分析以及GO功能显著性富集分析的方法筛选出嗅觉相关基因,并通过荧光定量PCR技术对黑须污蝇幼虫、蛹和成虫中OBP99b,OBP56a和OBP99a3个嗅觉相关基因表达水平进行验证.[结果]结果显示,每个黑须污蝇样本的转录组数据量在4.96 Gb以上,G+C含量在35.35％以上,Q20含量在97％以上.与NCBI_nr,GO,KEGG,Pfam,Swiss-Prot和eggNOG数据库进行对比,共注释到73 303条unigenes.其中eggNOG数据库注释到的unigenes最多,为35 066条,分布在23个蛋白功能中,其中的翻译修饰、蛋白质周转的unigenes所占比例较大;GO数据库注释到的unigenes数为29 193条,功能包括分子功能、细胞组分、生物学过程三大类50个分支,其中参与生物学过程和氧化还原过程的unigenes比例较大;KEGG数据库注释到的unigenes数为15 068条,其中参与信号转导过程的unigenes比例较大.上述数据表明该转录组测序结果较好,为后续研究奠定了基础.依据黑须污蝇幼虫、蛹、成虫转录组数据筛选到30个嗅觉相关基因,其中包含9个气味结合蛋白(OBP)基因,进一步基因注释发现OBP99b,OBP56a和OBP99a基因在黑须污蝇不同发育阶段表达差异显著(| log2FC |＞1,P＜0.05),这在荧光定量PCR分析结果中得到了验证.[结论]本研究获得了黑须污蝇幼虫、蛹和成虫转录组数据,筛选出黑须污蝇各发育阶段嗅觉相关基因,并验证了OBP99b,OBP56a和OBP99a基因在黑须污蝇幼虫、蛹和成虫3个发育阶段差异表达,为防治双峰驼阴道蝇蛆病提供了新思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	巴音吉日嘎拉	内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室	26	147	4.0	11.0
2	乌云高娃	内蒙古师范大学生命科学与技术学院	15	54	4.0	7.0
3	王超	内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室	13	23	3.0	4.0
4	包花尔	内蒙古农业大学兽医学院农业部动物疾病临床诊疗技术重点实验室	15	57	6.0	7.0