基因表达数据批次效应去除方法的研究进展

• 作者: 李飒 赵毅强
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 批次效应 基因表达谱 数据合并 评估方法
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 389-397
• 页数: 9页
• 分类号: Q-332
• 字数: 9188字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201810016

摘要

在组学和大数据时代,整合分析材料相同但时间、平台、方法、技术和实验室等不同批次的表达数据集将成为常态.但是,不同批次数据集由于非生物因素影响会产生批次效应,这种批次效应可能会对试验结果产生严重影响,甚至导致错误结论.本文介绍了几种去除基因表达数据批次效应的方法,包括ComBat方法、替代变量分析法、距离加权判别法和基于比值的方法等.通过前人研究和实例分析表明,ComBat方法是最好的去除基因表达谱数据集批次效应的方法.这些结果将为多批次表达数据集的整合分析提供参考依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵毅强	中国农业大学农业生物技术国家重点实验室	7	11	2.0	3.0
2	李飒	中国农业大学农业生物技术国家重点实验室	1	0	0.0	0.0