基于SLAF-seq技术的抗杨树叶锈病SNP位点开发

• 作者: 尹佟明 戴美丽 方乐成 李小平
• 来源期刊: 南京林业大学学报（自然科学版）
• 学科: 农学
• 关键词: 美洲黑杨 落叶松-杨栅锈菌 连锁遗传图谱 SLAF标签 Kruskal-Wallis检验
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 73-78
• 页数: 6页
• 分类号: S763.15
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2006.201806020

摘要

[目的]探索美洲黑杨抗叶锈病的分子机制,为杨树抗病分子育种提供理论参考.[方法]选取抗锈病差异显著的美洲黑杨‘2-2’与‘2-38’为亲本,通过控制授粉杂交获得80个F1代个体.用特异性位点扩增(specificlocus amplified fragmenl sequencinq,SLAF-seq)简化基因组技术对所获F1代进行深度测序,以美洲黑杨第3代组装基因组为参照.通过序列比对筛选特异长度的DNA片段,构建SLAF-seq文库,获得特异性SNP位点.经美洲黑杨叶锈病的病原菌经形态学与分子工具鉴定,确定为落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina Kleb.).通过叶盘法控制条件接种并对被锈菌侵染后的杨树抗性进行评估;应用Kruskal-Wallis方法对接种结果进行检验.[结果]通过接种,获得了孢子堆数量和大小等表型数据;基于SNP标记的连锁分析,一共有8 723个SNP连锁至遗传图谱上;共识别出19个连锁群,总遗传距离为3 610.67 cM;通过Kruskal-Wallis检验可得到37个紧密连锁位点(P＜0.005),标记分别位于Ⅰ、Ⅳ、Ⅵ、Ⅺ、ⅩⅤ和ⅪⅩ号连锁群上.[结论]利用SLAF-seq技术开发出了37个与杨树叶锈病抗病性状紧密关联的SNP分子标记,其中Marker42056位点连锁程度最高.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴美丽		1	0	0.0	0.0
2	方乐成		1	0	0.0	0.0
3	尹佟明		1	0	0.0	0.0
4	李小平		1	0	0.0	0.0