低致病性A/Anhui/1/2013(H7 N9)流感病毒感染小鼠肺组织的miRNA表达谱分析

• 作者: 刘志远 刘清政 周继勇 孙彤彤 平继辉 赵锦华 郭艳娜 黄楠
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 低致病性H7N9流感病毒 miRNA 基因芯片测序 表达谱
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 482-490
• 页数: 9页
• 分类号: S855.3
• 字数: 5890字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7685/jnau.201812037

摘要

[目的]本试验旨在利用基因芯片测序技术分析宿主miRNA在调控流感病毒感染小鼠肺组织过程中的作用.[方法]应用低致病性H7 N9亚型A/Anhui/1/2013流感病毒及PBS感染BALB/c小鼠,感染后3 d取小鼠肺组织分别利用转录组测序技术和miRNA芯片测序技术筛选差异表达mRNA和miRNA,并利用RT-qPCR验证差异miRNA.之后分别采用Targetscan、PITA及microRNAorg软件预测靶基因并结合转录组mRNA信息筛选候选miRNA的假定靶基因,最后利用Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes(KEGG)分析差异miRNA的生物学功能及其可能调控的信号通路.[结果]与PBS组相比,低致病性H7 N9病毒感染组共筛选到265个差异表达miRNA,其中143个miRNA显著上调,122个miRNA显著下调.差异表达miRNA经RT-qPCR验证,10条候选miRNA的RT-qPCR结果与芯片结果有非常好的一致性.进一步KEGG分析表明,这些差异表达miRNA主要富集在Rap1、PI3K-Akt、Hippo、MAPK、Wnt、黏着斑、自噬等免疫相关信号通路中.结合差异mRNA信息进行miRNA-mRNA调控网络分析,显示主要有15条差异表达miRNA和31个差异靶基因富集到这些信号通路中.[结论]成功筛选到了低致病性H7 N9感染小鼠肺组织后引起的差异表达miRNA,且RT-qPCR证明其与基因芯片测序结果表达趋势具有很好的一致性,为深入研究宿主miRNA在调控低致病性H7 N9流感病毒与宿主相互作用的分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周继勇	南京农业大学动物医学院	4	20	1.0	4.0
2	郭艳娜	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0
3	刘志远	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0
4	孙彤彤	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0
5	黄楠	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0
6	赵锦华	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0
7	刘清政	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0
8	平继辉	南京农业大学动物医学院	1	0	0.0	0.0