银耳芽孢和菌丝的转录组分析

• 作者: 朱涵予 陈政
• 来源期刊: 食品与机械
• 关键词: 银耳 菌丝体 芽孢 RNA-Seq
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 45-49,63
• 页数: 6页
• 字数: 4564字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13652/j.issn.1003-5788.2019.09.009

摘要

采用RNA-Seq技术对银耳菌丝M1332及其2个单核亲本芽孢Y13、Y32进行转录组测序,通过测序共获得13.16 G数据,从头(de novo)拼接后得到16190个基因(Unigene).利用NCBI的NR、COG、GO、KEGG等常用数据库对组装的Unigene进行同源性预测:NR数据库中的序列同源性比较表明,55.75％ 的Unigene比对到金黄银耳,13.35％比对到新型隐球酵母;与COG数据库进行比对得到7203个Unigene,根据其功能大致可分为25类;有3921个Unigene在GO数据库中注释到,分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类46个分支.差异表达基因的KEGG富集分析结果表明,差异基因富集在氨基糖和核酸糖的代谢、氨基酸代谢、细胞内噬等代谢通路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈政	衡阳师范学院生命科学与环境学院	1	0	0.0	0.0
2	朱涵予	衡阳师范学院生命科学与环境学院	3	0	0.0	0.0