高通量测序技术对早熟棉中miRNA的鉴定与分析

• 作者: 姚则羊 张艳丽 朱青竹 李增书 王虎 眭书祥 董章辉 赵丽芬 赵国忠 郭永召
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 棉花 miRNA 高通量测序 早熟
• 年，卷（期）: 2019,（z1）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 15-21
• 页数: 7页
• 分类号: S562.03
• 字数: 4413字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.20190698

摘要

棉花中miRNA的数量仍较少,miRNA在棉花早熟发育中的作用有待证明和揭示.为丰富棉花中miRNA的数量,同时,为揭示miRNA在早熟棉发育中的作用,以早熟棉花品种石早1和中熟棉花品种冀棉958为材料,利用高通量测序技术构建了2个小RNA文库,鉴定新的miRNA,比较早熟棉花和中熟棉花中miRNA表达的差异、特点.结果共鉴定到131个miRNA,包括41个不同家族的64个已知miRNA和67个新的miRNA;新miRNA中,54个miRNA属于已知miRNA家族,13个miRNA属于新的miRNA家族.比较2个品种中miRNA表达的差异,共发现39个miR-NA在2个品种中的表达差异超过2倍,占总miRNA数的29.8％,主要为中低量表达的miRNA.15个高表达miRNA中,只有miR398家族的ghr 21在2个品种中的表达差异超过2倍(达到3.4倍);比较相同家族的不同miRNA在两品种中的表达差异,发现相同家族的miRNA在2个品种中表达差异可以不同,推测有不同的生物学功能.揭示了miR-NA在早熟棉发育过程中,对其早熟性具有重要作用,为进一步研究miRNA在棉花早熟性调控中的作用提供依据.