志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列与毒力基因和耐药基因的关系

• 作者: 张晓萌 段广才 王颖芳 王鹏飞 詹煜慧 郗园林
• 来源期刊: 西安交通大学学报（医学版）
• 关键词: 志贺菌 成簇的规律间隔短回文重复序列 毒力基因 耐药基因
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 71-75
• 页数: 5页
• 分类号: Q93
• 语种: 中文
• DOI: 10.7652/jdyxb201901013

摘要

目的 探索志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)与毒力基因和耐药基因的关系.方法 从GenBank数据库中获得志贺菌的基因组、毒力基因和耐药基因的序列,通过多序列比对等方法获得志贺菌中CRISPR1、CRISPR2和CRISPR-Q1的分布情况、重复序列和间隔序列信息,通过BLAST方法获得毒力基因和耐药基因在志贺菌中的分布情况,SPSS 21.0软件分析CRISPR与毒力基因和耐药基因的关系.结果 志贺菌中的CRISPR1和CRISPR2在不同菌株中的间隔序列差别较大,CRISPR-Q1分布更为广泛(超过99％).毒力基因在志贺菌中分布比较广泛(均超过56％),耐药基因中的blaOXA-1、camr、Sul2、tetB分布也比较广(超过50％).CRISPR1/CRISPR2与是否携带9种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05),CRISPR-Q1与是否携带3种毒力基因、4种耐药基因有关(P<0.05).CRISPR1/CRISPR2和CRISPR-Q1均与志贺菌中存在的毒力基因和耐药基因的个数间有统计学关联(P<0.05).CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目之间存在统计学关联(χ2=61.6,P<0.001).结论 志贺菌中不同CRISPR的分布差异比较大,存在的间隔序列数目不等;志贺菌CRISPR与部分毒力基因和耐药基因之间存在负相关;CRISPR1/CRISPR2与CRISPR-Q1的间隔序列数目存在正相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	段广才	郑州大学公共卫生学院流行病学教研室	174	980	15.0	21.0
2	王颖芳	河南科技大学医学院公共卫生教研室	28	53	4.0	6.0
3	郗园林	郑州大学公共卫生学院流行病学教研室	119	673	13.0	20.0
4	王鹏飞		6	4	1.0	2.0
5	詹煜慧	河南科技大学医学院	3	0	0.0	0.0
6	张晓萌	河南科技大学医学院	2	0	0.0	0.0