禾花鲤与建鲤肌间骨miRNAs测序与分析比较

• 作者: 何苹萍 吴铁军 彭金霞 林勇 王卉 王韶韶 韦嫔媛 黄姻
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 禾花鲤 建鲤 肌间骨 miRNAs 高通量测序
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 页码范围: 757-762
• 页数: 6页
• 分类号: Q173
• 字数: 3917字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7541/2019.089

摘要

为了研究禾花鲤(Rice flower carp)肌间骨柔软的分子调控机制,采集禾花鲤和建鲤(Jian carp)的肌间骨进行micro RNAs(miRNAs)的高通量测序,并进行了生物信息学分析.从禾花鲤肌间骨的小RNA文库测序获得18—32 nt的高质量miRNA序列25474895条、鉴定出成熟miRNAs 595种,而从建鲤文库获得miRNA序列24625715条、成熟miRNAs 570种.表达差异分析结果显示,与建鲤相比,禾花鲤肌间骨中84个miRNAs呈上调表达、267个呈下调表达.禾花鲤下调表达的miRNAs中有7条为已报道的促进人类成骨的miRNAs,上调表达的miRNAs中有6条为已报道的抑制人类成骨的miRNAs.因此推测禾花鲤可能是通过下调表达促进成骨的miRNAs及上调表达抑制成骨的miRNAs来抑制成骨过程,从而维持其肌间骨细小及柔软的特性.研究为国内首次开展禾花鲤肌间骨发育的分子调控机制研究,为水产动物肌间骨发育的研究奠定了基础.