直刺变豆菜叶绿体全基因组及其特征

• 作者: StephenR.Downie 姚雪莹 王奇志 陈志祥
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: 高通量测序 变豆菜属 基因组装 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 植物多样性
• 页码范围: 366-372
• 页数: 7页
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2018332

摘要

直刺变豆菜(Sanicula orthacantha)是中国广泛分布的多年生草本植物,也是一味著名的民族药.本文通过二代高通量测序平台Illumina HiSeq PE 150对直刺变豆菜叶绿体全基因组进行测序,并通过生物信息学方法对其结构特征进行分析.结果 表明:直刺变豆菜叶绿体全基因组大小为157,163 bp,包括大单拷贝区(large single copy,LSC)、小单拷贝区(small single copy,SSC)和2个反向重复序列(inverted repeat sequence,IRa和IRb),长度分别为87,547 bp、17,122 bp和26,247 bp,具有典型被子植物叶绿体基因组环状四分体结构;共注释得到129个基因,包括8个核糖体RNA (rRNA)基因、37个转运RNA (tRNA)基因和84个蛋白质编码基因.直刺变豆菜在叶绿体基因组结构、基因种类、排列顺序上与其他伞形科植物基本一致.直刺变豆菜叶绿体全基因组测序的成功为变豆菜属植物完整叶绿体基因组组装及其特征分析提供了新的方法.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王奇志	华侨大学化工学院园艺系	30	117	6.0	8.0
2	陈志祥	华侨大学化工学院园艺系	4	1	1.0	1.0
3	姚雪莹	华侨大学化工学院园艺系	4	2	1.0	1.0