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白粉菌交配型位点基因结构及分子系统学关系
白粉菌交配型位点基因结构及分子系统学关系
作者:
刘淑艳
赵磊
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
白粉菌目
交配型位点
基因结构
系统发育
摘要:
白粉菌是一类植物专性寄生真菌,广泛分布于世界各地,可引起多种植物白粉病.开展白粉菌交配型基因研究可以为全面认识白粉菌的生活史循环和系统演化提供证据.本研究以子囊菌中已报道的10种MAT基因和4种侧翼基因的氨基酸序列为种子序列,采用生物信息学方法在21个白粉菌基因组中进行氨基酸同源性分析,探索MAT基因及其侧翼基因的种类和线性排布.结果 表明,21个白粉菌基因组中有10个属于MAT1-1型,包含MAT1-1-1和MAT1-1-3两种基因;10个属于MAT1-2型,仅包含MAT1-2-1基因;在Erysiphe pulchra的基因组中同时存在MAT1-1-1、MAT1-1-3、MAT1-2-1;而4种侧翼基因SLA2、APC5、APN2和CoxVia在21个白粉菌基因组中均存在.21个菌株中有两个菌株Blumeria graminis f.sp.hordei RACE1和Golovinomyces orontii的MAT基因和4种侧翼基因分布在同[个scaffold,其余菌株MAT基因和侧翼基因均不在同[scaffold出现.本研究分别分析了具有MAT1-1和MAT1-2的菌株中MAT基因和4种侧翼基因的排列关系,同时根据9个菌株的MAT基因注释信息,推测了其他菌株的MAT基因结构.结果 表明,同属白粉菌的MAT基因结构相同,属间MAT基因结构差异明显.以从白粉菌基因组中获得的MAT1-1-1、MAT1-1-3和MAT1-2-13种MAT基因序列分别构建系统发育树,发现布氏白粉菌属Blumeria、白粉菌属Erysiphe和戈洛文白粉菌属Golovinomyces分别形成独立分枝,且白粉菌属与戈洛文白粉菌属形成姊妹群,这与前人对白粉菌系统发育关系的研究结果[致.本研究得到的白粉菌MAT基因种类、分布及其结构的相关结果为进[步实验提供了理论依据,为探究白粉菌的系统发育提供了新的思路.
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篇名
白粉菌交配型位点基因结构及分子系统学关系
来源期刊
菌物学报
学科
关键词
白粉菌目
交配型位点
基因结构
系统发育
年,卷(期)
2019,(9)
所属期刊栏目
研究论文
研究方向
页码范围
1457-1469
页数
13页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13346/j.mycosystema.190134
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
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G指数
1
刘淑艳
吉林农业大学植物保护学院
51
351
9.0
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吉林农业大学植物保护学院
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研究来源
研究分支
研究去脉
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菌物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国菌物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1672-6472
CN:
11-5180/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
邮发代号:
2-499
创刊时间:
1982
语种:
chi
出版文献量(篇)
3221
总下载数(次)
8
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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