基于三代测序技术的微生物组学研究进展

• 作者: 王军 胡小茜 许亚昆 马越
• 来源期刊: 生物多样性
• 关键词: 微生物 三代测序 16S/18S rRNA 宏基因组
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 534-542
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.17520/biods.2018201

摘要

微生物在人类生活中无处不在,过去人们对微生物的认识仅停留在单菌培养和定性研究上,而测序技术的发展极大地促进了微生物组学的研究.越来越多的证据表明:人体共生微生物、特别是肠道微生物与人类健康息息相关.二代测序技术凭借其高通量、高准确率和低成本的特点,成为微生物组学研究中的主流测序技术.但是随着研究的深入,二代测序技术的短读长(＜ 450 bp)增加了后续数据分析和基因组拼接难度,也限制了该技术在未来研究中的应用.在此背景下,第三代测序技术应运而生.第三代测序技术又称单分子测序,能够直接对单个DNA分子进行实时测序,而不需要经过PCR扩增.第三代测序技术的平均读长在2-10 kb左右,最高可以达到2.2Mb,实现了长序列的高通量测序.凭借其超长的测序读长、无GC偏好性等优势,三代测序技术为微生物基因组全长测序,组装完整可靠的基因组提供了新的方法.本文在描述三代测序的技术特点和原理的基础上,重点介绍了三代测序技术在微生物16S/18S rRNA基因测序、单菌的基因组组装以及宏基因组中的研究应用和进展.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王军	中国科学院微生物研究所	176	3989	26.0	60.0
2	马越	中国科学院微生物研究所	8	28	4.0	5.0
6	许亚昆	中国科学院微生物研究所	1	4	1.0	1.0
10	胡小茜	中国科学院微生物研究所	1	4	1.0	1.0