马缨杜鹃ARF转录因子家族的全基因组鉴定与生物信息学分析

• 作者: 刘树文 张文香 张荣祥 王自布 钱长江 陈天兰
• 来源期刊: 北方园艺
• 学科: 农学
• 关键词: 马缨杜鹃 ARF 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（24）
• 所属期刊栏目: 园林花卉
• 页码范围: 74-80
• 页数: 7页
• 分类号: S685.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.11937/bfyy.20191097

摘要

以马缨杜鹃(Rhododendron delava yi)基因组数据为基础,以拟南芥ARF(AtARF)序列为参考,利用Blast比对程序,在马缨杜鹃基因组数据库中鉴定了15个ARF基因,命名为RdARF.使用生物信息学的方法对基因的结构、理化性质、系统进化关系以及表达模式进行了分析,以期为马缨杜鹃ARF基因的克隆及深入研究提供参考.结果 表明:15个RdARF蛋白均含有保守的B3结构域和Auxin-resp结构域,部分蛋白含有Aux/IAA结构域,共有10个保守基序,均含有丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化住点,均含有内合子和外显子结构,与23个AtARF蛋白一起可以分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅱa、Ⅱb和Ⅲ5个亚家族,15个RdARF基因在干旱胁迫前后具有4种不同的表达模式.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张荣祥	贵州师范学院生物科学学院	6	14	3.0	3.0
2	钱长江	贵州师范学院生物科学学院	31	94	6.0	7.0
3	张文香	贵州师范学院生物科学学院	7	18	3.0	4.0
7	王自布	贵州师范学院生物科学学院	22	35	3.0	5.0
11	陈天兰	贵州师范学院生物科学学院	1	0	0.0	0.0
12	刘树文	贵州师范学院生物科学学院	6	5	1.0	1.0