链霉菌L10608来源木聚糖酶xyn-GH10/11基因的克隆与生物信息分析

• 作者: 柳佳芸 熊科 熊苏玥 裴鹏钢 邓蕾 高思宇
• 来源期刊: 中国食品学报
• 关键词: 链霉菌 木聚糖酶 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 56-67
• 页数: 12页
• 语种: 中文
• DOI: 10.16429/j.1009-7848.2019.10.007

摘要

基于菌株L10608所产天然酶水解木聚糖底物时具有良好的水解木聚糖底物特性,通过设计简并引物,经巢式PCR克隆得到L10608菌株木聚糖酶基因全长(xyn-GH10与xyn-GH11),并对其进行生物信息学分析.由分析可知酶xyn-GH10全长1469 bp,分子质量:50.677 ku;理论等电点pI:7.98;预测该木聚糖酶的信号肽为MGIQALPRAAVRQKLRTPLPALAAGVLGLTAALVPPTNADA;该木聚糖酶蛋白序列具有明显的第10族糖苷水解酶的八叠桶型保守区域,且能编码一段由108个氨基酸组成的RicinB-lectin非催化结构域.木聚糖酶xyn-GH11全长729 bp;分子质量:24.003 ku;理论等电点pI:8.98;预测该木聚糖酶的信号肽为MHQDGSQQDRT QNPAPFGGLSRRGFLVGGTGAAALAAGSGLLLPGTAHAA.该木聚糖酶蛋白序列具有明显的第11族糖苷水解酶的"右手半握状"保守区域.xyn-GH10与xyn-GH11基因经原核表达后其中木聚糖酶xyn-GH10酶活为160 U/mL,木聚糖酶xyn-GH11酶活为55 U/mL.