变应性鼻炎患者鼻黏膜微小RNA的表达谱及其意义

• 作者: 冯娟 张华 张秀利 王燕 阳玉萍
• 来源期刊: 新疆医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 变应性鼻炎(AR) 微小RNA(miRNA) 表达谱 靶基因预测 京都基因和基因组百科全书(KEGG)
• 年，卷（期）: 2019,（10）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 1284-1289
• 页数: 6页
• 分类号: R765.21
• 字数: 3553字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1009-5551.2019.10.009

摘要

目的 探讨变应性鼻炎(AR)患者鼻黏膜微小RNAs(miRNAs)的表达谱特点,阐明miRNAs在AR的发病、诊断及治疗中的作用.方法 研究设AR组及非变应性鼻炎患者(对照组),对其鼻黏膜进行总RNA抽提,应用RNA-seq技术对鼻黏膜miRNA进行差异表达谱的分析.利用芯片技术,对miRNA进行二级结构的预测,从而判断和预测新的miRNA.比较2组新预测的miRNA的异常表达,筛选其miRNA,构建AR的新预测miRNA异常表达谱.结果 将所有序列与rfam数据库进行比对,得到其中miRNA的具体分布情况.通过miRNA芯片,检测共有172个新预测的miRNA在2组鼻黏膜组织中表达,而AR组标本中表达的miRNA共有351个,有84个预测的miRNA在AR组共同表达.在对照组样品中表达的有342个,有85个预测的miRNA在对照组共同表达.本研究数据得到的6个新预测的miRNA在样本间差异表达(P＜0.05).对于得到的新预测的miRNA,使用软件miRand、RNAhybrid预测其靶基因.以新预测的12_8883为例,其对应的miRNA靶基因为34个.差异表达miRNA靶基因富集,得到差异表达新的miRNA与8条通路有关,分别是轴突指导、突触小泡循环、急性髓性白血病、胞吞作用、ErbB信号通路、Ras信号通路、黑色素瘤和赖氨酸降解.结论 变应性鼻炎患者涉及多个新预测的miR-NA,以及不同的信号通路,可能为AR患者的发病机制的研究提供新的思路.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王燕	新疆医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科	190	818	15.0	20.0
2	张华	新疆医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科	246	1096	15.0	21.0
3	冯娟	新疆医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科	58	206	8.0	12.0
4	阳玉萍	新疆医科大学第一附属医院耳鼻咽喉科	38	84	5.0	7.0
5	张秀利		1	1	1.0	1.0