猪细小病毒6型全基因组克隆及遗传进化分析

• 作者: 孙裴 张达 李永东 杨侃侃 王勇 王小朋 白彩霞 赵靓
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪细小病毒6型 全基因组 同源性分析 遗传进化分析
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 1154-1160
• 页数: 7页
• 分类号: S852.65
• 字数: 3948字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2019.05.022

摘要

对猪细小病毒6型(PPV6)安徽分离株PPV6 AH进行全基因组序列克隆,并进行遗传进化树构建及同源性分析.将病毒基因分10段进行PCR扩增并测序,用SeqMan进行拼接,获得全基因组序列.将PPV6 AH株与GenBank中PPV6其他毒株进行遗传进化分析.结果显示,PPV6 AH基因组全长6180 bp,与其他国内外15株PPV6全基因的核苷酸序列同源性达到97.1％～99.5％.基于PPV6全基因、NS1及Cap基因构建的遗传进化树显示PPV6 AH株与PPV6 BJ、BJ2、SC及JS株有着共同的进化起源.NS1基因第708、996、1932核苷酸位点发生突变;Cap基因在第1205、1211、1582、1614核苷酸位点发生突变;Cap蛋白氨基酸在第402和404位点发生突变.本研究首次报道PPV6在安徽省猪群中存在,该研究结果为安徽地区PPV6的分子遗传进化特征提供了一定的参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙裴	安徽农业大学动物科技学院	89	404	11.0	15.0
2	王勇	安徽农业大学动物科技学院	25	82	4.0	9.0
3	李永东		13	39	4.0	5.0
4	白彩霞	安徽农业大学动物科技学院	4	0	0.0	0.0
5	杨侃侃	安徽农业大学动物科技学院	3	0	0.0	0.0
6	赵靓	安徽农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
7	王小朋	安徽农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0
8	张达	安徽农业大学动物科技学院	1	0	0.0	0.0