甘蓝NLR家族全基因组鉴定、进化分析及在不同病害胁迫下的表达分析

• 作者: 刘星 吕红豪 孔枞枞 庄木 张扬勇 方智远 杨丽梅 王勇 邢苗苗
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝 NLR家族基因 抗病 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 723-737
• 页数: 15页
• 分类号: S635
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0804

摘要

从全基因组水平鉴定了87个甘蓝NLR基因家族成员, 并对其进行了进化分析和表达分析.基因结构和motif组成分析表明, 87个基因可分为5个亚类:NB-LRR (34个) 、CC-NB-LRR (6个) 、TIR-NB-LRR (45个) 、RPW8-NB-LRR (1个) 和CC-TIR-NB-LRR (1个);染色体定位分析表明, 该家族基因在9条染色体上呈不均匀地单一或成簇分布;进化分析表明, 甘蓝35个NLR基因与白菜NLR基因存在同源关系, 其余52个基因为甘蓝特有;利用转录组数据分析了参与甘蓝枯萎病、黑腐病、根肿病、霜霉病、白粉病等抗性应答相关的差异表达基因, 发现参与不同病害胁迫抗性应答反应的NLR基因差异较大, 这可能与不同NLR基因对不同病原特异性识别有关.