巴哈雀稗PnDREB2基因克隆及时序表达图谱构建

• 作者: 张宇君 张雄 曾庆飞 王普昶 董瑞 赵丽丽 陈超
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 巴哈雀稗 非生物胁迫 RNA-Seq RT-qPCR 时序表达
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 7-15
• 页数: 9页
• 字数: 6487字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.01.0007

摘要

脱水反应元件结合蛋白(DREBs)在植物非生物逆境胁迫中可调节下游一系列抗逆基因的表达.为探究巴哈雀稗DREB2基因在逆境胁迫下的功能,本研究采用RNA-Seq结合RT-PCR技术从巴哈雀稗中获得一个DREB2基因CDS区全序列,命名为PnDREB2(GenBank登录号:MH 150946).核苷酸序列分析表明,该基因开放阅读框全长774 bp,编码257个氨基酸,相对分子质量为28.09 kD,理论等电点为5.25;该植物蛋白中具有DREB类基因家族典型的保守域AP2结构域,属于DREB2类转录因子A类中A2亚类的亚型1.进化和聚类分析结果表明,巴哈雀稗PnDREB2基因与高粱、割手密、玉米、谷子及牛鞭草亲缘关系较近,氨基酸序列同源性分别为91.10％、89.50％、88.20％、87.60％和87.60％.RT-qPCR和生物信息学分析表明,PnDREB2基因在茎中表达量最高,幼穗次之,叶最低;表达产物定位于细胞质中,具有26个磷酸化位点,并具有结构和功能的特异性.PnDREB2表达量受干旱(PEG-6000,20％)和高温(40℃)的强烈诱导,同时也受到高盐(NaCl,300 mmol·L-1)、低温(4℃)、脱落酸(ABA,100μmol· L-1)和赤霉素(GA,100 μmol·L-1)等非生物胁迫和激素的不同程度诱导,随着处理时间的延长,整体上均呈先增加后降低的趋势.本试验为巴哈雀稗抗逆分子机理研究与抗性增强的转基因材料培育奠定了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵丽丽	贵州大学动物科学学院草业科学系	74	469	13.0	17.0
2	曾庆飞	贵州省农业科学院草业研究所	12	37	4.0	6.0
3	陈超	贵州大学动物科学学院草业科学系	89	600	13.0	20.0
4	张宇君	贵州大学动物科学学院草业科学系	5	0	0.0	0.0
6	王普昶	贵州省农业科学院草业研究所	7	6	2.0	2.0
9	张雄	贵州省农业科学院畜牧兽医研究所	9	4	1.0	1.0