实验用SPF大白猪和长白猪母系遗传结构分析

• 作者: 权金强 辛畅 陈洪岩 马璐璐 高彩霞
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 无特定病原体(SPF)猪 mtDNA 控制区 母系遗传结构
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 97-107
• 页数: 11页
• 分类号: S813.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.01.011

摘要

无特定病原体(specific pathogen free,SPF)大白猪(Sus scrofa)和长白猪作为重要的实验动物,其遗传学质量控制研究十分必要.为分析实验用SPF大白猪、长白猪的线粒体DNA(mitochondrial DNA,mtDNA)控制区(displacement-loop region,D-loop区)遗传多样性,揭示其母系遗传结构,本研究提取SPF大白猪和长白猪基因组DNA,同时以我国地方品种巴马小型猪和融水小型猪为对照,应用PCR技术扩增其mtDNA D-loop区,进行测序比对.结果显示,107个样本中共检测到40个多态位点,分为13个单倍型,与地方品种相比,大白猪和长白猪单倍型数较少,分别含有3种和2种特有单倍型,只有1个共享单倍型H4.两猪群中各存在1个优势单倍型.单倍型多样度(Hd)分析,融水小型猪单倍型多样度最高(0.767),长白猪最低(0.429),大白猪和巴马小型猪分别为0.566和0.503.此外,中介网络关系图和系统进化树发现大白猪和长白猪与欧洲猪种亲缘关系较近.本研究表明实验用SPF大白猪和长白猪种群的单倍型数较少,各存在1个优势单倍型,遗传多样性低,具有清晰的母系遗传结构.研究结果有利于进一步的实验动物标准化以及遗传质量控制研究.