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南方红豆杉MCT基因克隆、功能验证及组织表达特异性检测
南方红豆杉MCT基因克隆、功能验证及组织表达特异性检测
作者:
曾令江
杨春贤
杨颖舫
简东琴
原文服务方:
南方农业学报
南方红豆杉
2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸胱氨酰转移酶(MCT)
生物信息学分析
功能验证
紫杉醇
摘要:
[目的]克隆南方红豆杉的2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸胱氨酰转移酶(MCT)基因(TcMCT),分析其功能,并检测组织表达特异性,为深入研究TcMCT基因在紫杉醇生物合成中的作用机制提供理论依据.[方法]采用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得TcMCT基因的cDNA全长序列,对其编码蛋白进行生物信息学分析及亚细胞定位,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测TcMCT基因的组织表达模式,并在大肠杆菌中超表达该基因以验证其功能.[结果]克隆获得的TcMCT基因cDNA序列全长为1293 bp,开放阅读框(ORF)为942 bp,编码313个氨基酸.TcMCT蛋白与其他植物MCT蛋白中均含保守的MEP结合位点和CTP结合位点,但在N端氨基酸序列保守性较差,其中与同为裸子植物银杏GbMCT蛋白的亲缘关系最近,氨基酸序列的相似性为59.3%.TcMCT蛋白的三级结构与AtMCT蛋白相似,均属于同源二聚体.TcMCT蛋白N端含84个氨基酸残基的质体转运肽,且以Arg88作为切割位点,定位于叶绿体中.TcMCT基因在南方红豆杉不同组织中均有表达,在绿色树皮中的相对表达量显著高于其他组织(P<0.05,下同),且在老叶和嫩叶中的相对表达量显著高于茎和根,在茎和根中的表达量极少甚至不表达.大肠杆菌中超表达TcMCT基因可促进β-胡萝卜素大量积累.[结论]不同物种MCT氨基酸序列具有较高的保守性,TcMCT基因具有明显的组织表达特异性,可调控萜类物质如β-胡萝卜素等的生物合成,推测其在紫杉醇生物合成中发挥重要调控作用.
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篇名
南方红豆杉MCT基因克隆、功能验证及组织表达特异性检测
来源期刊
南方农业学报
学科
关键词
南方红豆杉
2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸胱氨酰转移酶(MCT)
生物信息学分析
功能验证
紫杉醇
年,卷(期)
2019,(7)
所属期刊栏目
作物遗传育种·种质资源·分子生物学
研究方向
页码范围
1408-1416
页数
9页
分类号
S791.49
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.2095-1191.2019.07.02
五维指标
作者信息
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姓名
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1
杨春贤
西南大学生命科学学院
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曾令江
西南大学生命科学学院
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西南大学生命科学学院
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杨颖舫
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南方红豆杉
2-C-甲基-D-赤藓醇-4-磷酸胱氨酰转移酶(MCT)
生物信息学分析
功能验证
紫杉醇
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研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
南方农业学报
主办单位:
广西壮族自治区农业科学院
出版周期:
月刊
ISSN:
2095-1191
CN:
45-1381/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1964-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7029
总下载数(次)
0
总被引数(次)
43586
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