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牦牛Lkb1基因编码区克隆及其在骨骼肌的表达分析
牦牛Lkb1基因编码区克隆及其在骨骼肌的表达分析
作者:
字向东
李键
林亚秋
柏雪
熊显荣
熊燕
雷召雄
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
牦牛
Lkb1基因
骨骼肌
表达分析
生物信息学分析
摘要:
研究表明肝激酶b1(liver kinase b1,Lkb1)在小鼠(Mus musculus)骨骼肌发育与机体能量代谢调控中发挥重要作用.牦牛(Bos grunniens)作为青藏高原及毗邻地区的特有家畜,其骨骼肌的生长发育是影响产肉性能的主要因素之一.为研究Lkb1在牦牛骨骼肌生长发育及能量代谢中的潜在生物学功能,本研究以金川牦牛背最长肌cDNA为模板,采用PCR技术克隆LkbJ基因的CDS序列,并通过生物信息学方法,预测牦牛Lkb1氨基酸序列的理化性质、分析其在物种间的保守性;最后利用qRT-PCR技术检测Lkb1基因在成年金川牦牛不同组织中的表达模式,并且分析Lkb1基因在同龄不同品种牦牛骨骼肌的表达差异.研究结果显示,牦牛Lkb1基因的CDS序列全长为1 317 bp (GenBank登录号:MH412713),编码438个氨基酸.预测Lkb1蛋白为具有核质穿梭、发生磷酸化/去磷酸化的亲水性蛋白,可能参与调节机体能量和脂肪酸代谢.物种的保守性分析发现牦牛Lkb1基因与绵羊(Ovis aries)和山羊(Capra hircus)的同源性最高,经核苷酸和氨基酸序列比对同源性均高达97.50%和99.54%;而与小鼠核苷酸和氨基酸序列的同源性仅为45.48%和44.19%.基因表达分析显示,Lkb1基因在成年金川牦牛的骨骼肌中具有较高的表达量,在脂肪和肝脏组织中的表达量相对较低.在不同品种中,金川牦牛半腱肌Lkb1表达量显著高于麦洼牦牛(P<0.05),由此推测,Lkb1基因可能与牦牛骨骼肌的生长和能量代谢相关.该研究结果为进一步揭示Lkb1的功能和调控机制提供参考资料.
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文献信息
篇名
牦牛Lkb1基因编码区克隆及其在骨骼肌的表达分析
来源期刊
农业生物技术学报
学科
农学
关键词
牦牛
Lkb1基因
骨骼肌
表达分析
生物信息学分析
年,卷(期)
2019,(1)
所属期刊栏目
研究论文与报告
研究方向
页码范围
71-79
页数
9页
分类号
S823
字数
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1674-7968.2019.01.008
五维指标
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骨骼肌
表达分析
生物信息学分析
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
农业生物技术学报
主办单位:
中国农业大学
中国农业生物技术学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1674-7968
CN:
11-3342/S
开本:
大16开
出版地:
北京海淀区圆明园西路2号中国农业大学生命科学楼1053室
邮发代号:
2-367
创刊时间:
1993
语种:
chi
出版文献量(篇)
4211
总下载数(次)
8
总被引数(次)
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