基于焦磷酸测序研究雪豹肠道微生物多样性

• 作者: 丁慧霞 刘咪 姜文君 朱静 董欣 袁坤 陈佳欣 陈磊 高迎
• 来源期刊: 野生动物学报
• 关键词: 肠道微生物 雪豹 16SrRNA基因 焦磷酸测序
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 873-881
• 页数: 9页
• 分类号: Q93
• 语种: 中文

摘要

通过采集健康成年雪豹的新鲜粪便样品,借助高通量焦磷酸测序技术对雪豹肠道微生物多样性进行研究,并进行个体间差异的比较,为雪豹的救护饲养和营养生态学研究提供资料.研究结果表明,雪豹粪便微生物共包括9个细菌门,18个纲,31个目,64个科,82个属.其中丰度最高的5个细菌门分别是厚壁菌门(Firmicutes)(26.58％—46.59％),放线菌门(Actinobacteria)(29.21％—46.59％),拟杆菌门(Bacteroidetes)(1.61％—16.26％),梭杆菌门(Fusobacteria)(2.03％—24.78％)和变形菌门(Proteobac-teria)(3.10％—5.79％).放线菌门的红蝽菌科(Coriobacteriaceae)是雪豹粪便微生物中丰度最高的科.除样品5之外,红蝽菌科(Coriobacteriaceae)的丰度在其他样品中均占OTU总数的40％以上.柯林斯氏菌属(Collinsella)是雪豹粪便微生物中丰度最高的属.多样性分析表明雪豹肠道微生物群落具有较大的个体差异.