毛竹B3家族全基因组鉴定及表达模式分析

• 作者: 俞率成 傅鹰 刘志刚 吴佳军 周明兵
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 毛竹 B3家族 基因结构 进化关系 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告
• 页码范围: 43-54
• 页数: 12页
• 分类号: S795.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2019.01.005

摘要

B3家族是一类含有B3功能域的转录因子家族,在植物的生长发育过程中起重要的调控作用.本研究利用生物信息学的技术和手段共鉴定出78条毛竹(Phyllostachys edulis) B3家族基因,其在LAV(LEAFY COTYLE-DON2[-LEC2]-ABSCISIC ACID INSENSITIVE3[ABI3]-VAL)、生长素应答因子(auxin response factor,ARF)、RAV(Related ABI3-VP1)和生殖分生组织(reproduction meristem,REM)4个亚家族中均有分布.通过对毛竹7个组织材料的转录本进行分析发现78条毛竹B3家族基因表达模式可分为5类,第1类的15个基因主要在花序中大量表达,第2类的20个基因主要在根中大量表达,第3类的23个基因主要在笋中大量表达,第4类的7个基因主要在叶中大量表达,第5类的13个基因主要在竹鞭中大量表达.在4个亚家族中,每个家族挑取2个基因,通过qRT-PCR分析毛竹B3家族基因在毛竹笋中不同部位的表达模式,结果显示,在大多数节间组织中大多数B3家族成员都有较高的表达量;在节隔,只有2个基因有高水平表达;在笋箨中,有6个基因有高水平表达,其中有1个基因几乎不表达;在根中,只有1个基因有高水平的表达.本研究对毛竹B3家族全基因组进行了结构的鉴定、进化关系的研究和表达模式的分析,为毛竹B3家族基因功能的深入研究提供了良好的数据基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周明兵	浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室	14	19	3.0	3.0
5	吴佳军	浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
6	俞率成	浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
7	刘志刚	浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室	1	0	0.0	0.0
8	傅鹰	浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室	5	9	2.0	3.0