生物信息学方法预测COL4A1在胃癌中的表达及临床预后意义

• 作者: 何杰 王亮 王伟 陈瑶
• 来源期刊: 肿瘤药学
• 学科: 医学
• 关键词: 胃癌 Ⅳ型胶原蛋白α1 预后 生物信息学 免疫组化标记 信号通路富集
• 年，卷（期）: 2019,（4）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 626-631,652
• 页数: 7页
• 分类号: R735.2|R34
• 字数: 3840字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.2095-1264.2019.04.20

摘要

目的 探索Ⅳ型胶原蛋白α1 (COL4A1)在胃癌中的表达水平及临床预后意义.方法 利用GEPIA、Oncomine、Kaplan-Meier Plotter等生物信息学在线分析网站,挖掘分析大型癌症公共数据TCGA及GEO中胃癌患者COL4A1的mRNA及蛋白表达信息,并采用Kaplan-Meier法进行生存分析,.进一步应用DAVID及String在线工具分析COL4A1的可能调控信号通路及构建蛋白互作网络.结果 GEPIA、Oncomine及Kaplan-Meier Plotter数据库(分别源于TCGA和GEO数据)分析结果显示,与正常对照组相比,COL4A1基因在胃癌中呈现明显高表达(P＜0.05).免疫组织化学检测结果显示,COL4A1蛋白在胃癌中亦呈高表达.Kaplan-Meier单因素生存分析结果显示,与低表达组相比,COL4A1高表达组胃癌患者的总生存时间显著减少(P＜0.05).DAVID网站富集分析结果显示,COL4A1在胃癌中的作用机制可能与ECM受体相互作用等通路有关.结论 COL4A1在胃癌组织中高表达,并与胃癌患者不良预后相关,未来可能成为胃癌治疗的潜在新靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王伟	中国科学技术大学附属第一医院肿瘤内科	295	3192	30.0	44.0
2	何杰	安徽省肿瘤医院病理科	13	8	2.0	2.0
3	王亮	安徽省肿瘤医院病理科	4	1	1.0	1.0
4	陈瑶	安徽省肿瘤医院病理科	1	0	0.0	0.0