细粒棘球绦虫原头蚴lncRNA表达谱分析

• 作者: 刘乙 孟季蒙 张艳艳 徐梦飞 王正荣 薄新文 马勋
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 细粒棘球绦虫 lncRNA 原头蚴 表达谱
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1864-1873
• 页数: 10页
• 分类号: S852.734
• 字数: 6073字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.09.014

摘要

本研究旨在解析lncRNA在细粒棘球绦虫原头蚴中的表达谱特性,为进一步揭示lncRNA在细粒棘球绦虫原头蚴发育中的作用及调控机制提供理论依据.从患病绵羊肝无菌采集细粒棘球绦虫原头蚴,提取总RNA,构建原头蚴lncRNA文库,利用RNA sequencing技术进行测序分析.结果 表明,首次从细粒棘球绦虫原头蚴中鉴定出609个新的lncRNA分子.其中intergenic lncRNA有431个,intronic lncRNA有11个,anti-sense lncRNA有68个,sence lncRNA有99个.GO分析表明,其表达量前200的lncRNA分子主要与MAP激酶的负调控、SMC结合复合物、IMP的生物合成以及乙酰转移酶激活剂活性相关.KEGG分析结果表明,其表达量前200的lncRNA分子主要与细胞凋亡、萜类骨架生物合成、碳代谢以及背腹轴形成相关.cis分析结果表明,在这609个新的ln-cRNA分子中,与虫体Wnt信号通路、Hedgehog信号通路、NF-KB信号通路、cAMP信号通路、Notch信号通路、胆酸盐信号通路以及背腹轴信号通路相关的lncRNA分子分别有79、31、10、128、43、84和73个.qRT-PCR的验证结果表明,表达量前10的lncRNA分子与测序结果一致.RNA荧光探针原位杂交结果表明,高表达的lncRNA分子在细粒棘球绦虫原头蚴吸盘以及表皮均有表达.综上所述,本研究首次解析了细粒棘球绦虫原头蚴中lncRNA的表达谱特性,丰富了细粒棘球绦虫lncRNA的数据,为进一步解析lncRNA在细粒棘球绦虫原头蚴发育中的作用奠定了基础.