葡萄NHX基因家族的鉴定和表达分析

• 作者: 何红红 卢世雄 梁国平 毛娟 王萍 许春苗 陈佰鸿
• 来源期刊: 果树学报
• 学科: 农学
• 关键词: 葡萄 NHX基因家族 胁迫 qRT-PCR
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 种质资源·遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 266-276
• 页数: 11页
• 分类号: S663.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.13925/j.cnki.gsxb.20180361

摘要

[目的]探究葡萄NHX基因家族生物信息学特性及在非生物胁迫下的表达情况,以期筛选出与非生物胁迫相关的家族成员,从而为葡萄抗逆性研究提供理论依据.[方法]以拟南芥、水稻及胡扬NHX基因序列为基础,对葡萄NHX基因进行同源克隆、染色体定位、氨基酸组成成分、理化性质、motif、蛋白质二级结构以及基因芯片表达等分析,同时利用qRT-PCR技术分析葡萄NHX基因家族表达情况.[结果]葡萄NHXs可分为2个亚族,主要分布在第1、5、7、14、15、19号染色体上,其外显子数为12～23个;VvNHX06的氨基酸数最少,有291个,VvNHX07的氨基酸数最多,有1 141个.Motif分析发现,N端含有典型的锌指结构,蛋白质二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.亚细胞定位预测发现,葡萄NHX基因主要分布在细胞膜、内质网、线粒体、液泡和细胞质中.基因芯片表达显示,使用NaC1、ABA和PEG处理后,葡萄叶片中VvNHX02和VvNHX06基因表达量均呈上升趋势.qRT-PCR分析结果表明,在200 mmol· L-1NaC1、100 mmol· L1ABA处理后的葡萄叶片中,VvNHX06表达量显著增加,分别是对照的30倍和60倍.用10％ PEG处理实验材料6h后,VvNHX05的表达量明显增加,是对照的5倍.[结论]VvNHX0和VvNHX06基因与植物耐盐和抗旱性有密切关系,可为葡萄的逆境胁迫机制研究提供参考.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈佰鸿		128	886	13.0	25.0
2	毛娟		91	429	10.0	18.0
3	王萍		22	26	3.0	4.0
4	何红红		12	6	2.0	2.0
5	梁国平		13	7	2.0	2.0
6	卢世雄		10	4	1.0	1.0
7	许春苗		1	0	0.0	0.0