偏肿革裥菌细胞色素P450基因在刚果红脱色条件下的差异表达

• 作者: 张健 李晨语 李梦珠 池玉杰 王泽慧
• 来源期刊: 东北林业大学学报
• 关键词: 偏肿革裥菌 细胞色素P450 染料降解 基因差异表达
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 页码范围: 118-122
• 页数: 5页
• 分类号: S718.81
• 语种: 中文

摘要

为了明确白腐真菌偏肿革裥菌(Lenzites gibbosa)降解双偶氮染料刚果红过程中细胞色素P450基因的功能,采用高通量测序技术对刚果红染料处理0、3、7、10 h下的菌丝样本进行转录组测序,以比对到参考基因组上的每个基因的reads数即Count值作为表达量值,根据基因在对照组(0 h)和染料处理组(3、7、10 h)中表达量的变化,用DESeq EBSeq软件进行样品组间的差异基因表达分析和差异基因筛选,对差异表达基因(DGEs)在egg-NOG、GO和KEGG等数据库中进行功能注释与通路富集分析,对筛选出的相关差异基因在NCBI上进行DNA序列比对,并与相关参考文献进行比较分析.结果表明:在转录组所有的DGEs中,搜索出11个可能影响L.gibbosa降解刚果红过程的细胞色素P450基因,其中在CK vs GGH1(0 vs 3 h)中未筛选出细胞色素P450差异基因,在CK vs GGH2(0 vs 7 h)中筛选出3个差异基因,在CK vs GGH3(0 vs 10 h)中筛选出8个差异基因,表明在L.gibbosa对刚果红染料脱色降解过程中细胞色素P450基因逐步参与了降解脱色过程.在10 h时,被注释到木质素降解关键通路ko 01220(芳香族化合物降解)中的gene 25488表现出差异表达.从11个细胞色素P450基因的差异表达中可以探究并揭示出一些潜在的生物学规律,最终结果表明L.gibbosa的细胞色素P450基因与双偶氮类染料刚果红的降解脱色有一定的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	池玉杰		75	791	12.0	25.0
2	张健		66	492	11.0	20.0
3	李梦珠		1	0	0.0	0.0
4	李晨语		1	0	0.0	0.0
5	王泽慧		1	0	0.0	0.0