牦牛HYOU1基因克隆及组织表达分析

• 作者: 信金伟 季文博 柴志欣 王会 王吉坤 钟金城
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 牦牛 黄牛 HYOU1基因 生物信息学分析 组织表达谱
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 123-131
• 页数: 9页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2018-0852

摘要

为探究HYOU1基因在牦牛中的组织表达谱,通过对西藏牦牛HYOU1基因的CDS区进行克隆测序,分析该基因的结构和功能,采用RT-PCR技术检测黄牛和牦牛肺脏、心脏、肝脏、乳腺、大脑及肌肉中HYOU1基因的相对表达量.结果 表明:(1) HYOU1基因CDS区长度为3006 bp,其中A、G、C和T含量分别为25.0％、31.1％、26.7％和17.1％,存在一定碱基偏好性;发现1个(ACG→ACA) SNP位点,为同义突变.(2)生物信息学分析表明该蛋白呈中性,为较不稳定、亲水性分泌信号蛋白;存在一个跨膜螺旋(TMhelix)区位于13-35氨基酸位置;二、三级蛋白结构分析发现其主要的空间构象为:无规则卷曲及α-螺旋.(3)聚类分析显示,西藏牦牛与野牦牛的遗传距离最近,与瘤牛及普通牛的遗传距离次之,与水牛最远.(4) RT-PCR结果显示HYOU1基因在黄牛和牦牛肝脏、乳腺、肺脏、大脑、心脏、肌肉6个组织中均有表达,且相对表达量依次递减;在相同组织中,黄牛组织的表达量均显著高于牦牛组织中的表达量(P＜0.05),其中黄牛肝脏组织的表达量为牦牛表达量的4.4倍.