紫背天葵及其近缘种白子菜花青素合成相关基因分析

• 作者: 张少平 张帅 林宝妹 洪佳敏 邱珊莲 郑开斌
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 紫背天葵 白子菜 转录组测序 花青素 合成代谢酶
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 516-524
• 页数: 9页
• 分类号: S661.2
• 字数: 5008字
• 语种: 中文
• DOI: 10.19303/j.issn.1008-0384.2019.05.003

摘要

[目的]获取紫背天葵花青素合成代谢核心酶系列信息,为进一步从事紫背天葵或其他特色植物中花青素合成代谢相关基础研究提供依据.[方法]以紫背天葵为材料,以其近缘种白子菜为对照,进行转录组测序分析.[结果]在获取的80798条单基因簇中,通过8个数据库比对分析,共有43369条注释到相关信息.这些单基因簇在NR及Swiss-Prot这2个数据库中注释到花青素合成代谢相关系列酶为104个,具体包括10个查尔酮合成酶、5个查尔酮异构酶、36个黄烷酮3-羟化酶、19个二氢黄酮醇4-还原酶、9个花青素合成酶和25个类黄酮3-O-糖基转移酶.通过FPKM均值统计分析可知,这6大家族酶在该两种野菜中表达量差异明显的分别有1、1、3、4、2、4个.在这15个差异表达明显基因中,上调基因7个、下调基因8个.[结论]获取的紫背天葵及其近缘种白子菜中的104个相关酶系列信息中,有15个与紫背天葵花青素合成代谢密切相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郑开斌	福建省农业科学院亚热带农业研究所	125	346	9.0	12.0
2	张少平	福建省农业科学院亚热带农业研究所	91	247	8.0	10.0
3	邱珊莲	福建省农业科学院亚热带农业研究所	69	275	9.0	14.0
4	张帅	福建省农业科学院亚热带农业研究所	51	103	6.0	8.0
5	洪佳敏	福建省农业科学院亚热带农业研究所	47	70	5.0	7.0
6	林宝妹	福建省农业科学院亚热带农业研究所	39	38	4.0	5.0