香椿染色体核型分析及SSR分子标记开发

• 作者: 于鹏飞 刘常金 孙晓健 张旭 李晨晨 郑威
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香椿 染色体 核型分析 SSR 转录组
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1172-1182
• 页数: 11页
• 分类号: S644.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0903

摘要

对香椿进行染色体核型分析和SSR分子标记的开发.染色体核型分析发现两个居群的香椿染色体数都是56条,为2A型,香椿的染色体较为原始,变异较小.转录组测序结果共获得66 921条Unigene,从中检索得到13 324个SSR位点,分布于11 184条Unigene中,SSR出现频率为19.91％,平均分布距离为3.84 kb.优势重复基序为单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸,分别占SSR总数的62.33％、19.66％和15.99％,单核苷酸A/T为优势重复基元,占总SSR的62.23％,二核苷酸以AG/CT为主要重复基元,占总位点的10.31％,三核苷酸以AAG/CTT为主要重复基元,占4.85％.利用Primer 3.0设计了8 218对引物,随机选取了19对引物对17个香椿种质进行PCR扩增,6对引物显示出可重复的多态性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘常金	天津科技大学新农村发展研究院	49	283	10.0	14.0
5	于鹏飞	天津科技大学新农村发展研究院	3	0	0.0	0.0
9	孙晓健	天津科技大学食品工程与生物技术学院	3	0	0.0	0.0
10	李晨晨	天津科技大学食品工程与生物技术学院	3	0	0.0	0.0
11	张旭	天津科技大学食品工程与生物技术学院	5	25	4.0	5.0
12	郑威	天津科技大学食品工程与生物技术学院	1	0	0.0	0.0