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摘要:
目的 通过分析GEO数据库中的基因芯片数据,筛选宫颈癌相关的差异表达基因.方法 从GEO数据库中下载宫颈癌相关基因表达数据集GSE9750和GSE63514,利用GEO2R工具筛选差异表达基因;利用DAVID在线工具进行GO和KEGG富集途径分析;利用GSE7803、GSE39001和TCGA中的数据对结果进行验证.结果 共筛选出176个宫颈癌相关差异表达基因,包括上调基因41个,下调基因135个;INHBA基因在宫颈癌组织中高表达,且与患者的总生存期(HR=2.5,P<0.01)和无病生存期呈负相关(HR=2.7,P<0.01).结论 通过分析GEO中的基因芯片数据获得多个宫颈癌发病相关的基因,INHBA基因可作为患者的诊断及预后评估的潜在新分子标记.
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文献信息
篇名 宫颈癌相关差异表达基因的筛选及预后价值分析
来源期刊 临床检验杂志 学科 医学
关键词 宫颈癌 GEO数据库 差异表达基因 预后分析
年,卷(期) 2019,(8) 所属期刊栏目 调查研究
研究方向 页码范围 633-637
页数 5页 分类号 R446|R734.2
字数 3368字 语种 中文
DOI 10.13602/j.cnki.jcls.2019.08.17
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 李娜 湖南医药学院第一附属医院病理科 3 2 1.0 1.0
5 曾丽平 湖南医药学院医学院病理教研室 7 4 2.0 2.0
6 方贤磊 湖南医药学院医学院病理教研室 4 0 0.0 0.0
7 罗方 湖南省妇幼保健院检验科 1 0 0.0 0.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
宫颈癌
GEO数据库
差异表达基因
预后分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床检验杂志
月刊
1001-764X
32-1204/R
大16开
南京市中央路42号
28-104
1983
chi
出版文献量(篇)
5950
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22
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