果梅NAC基因家族的鉴定及组织表达分析

• 作者: 侍婷 倪晓鹏 倪照君 姚丹 渠慎春 高志红
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 果梅 NAC基因家族 生物信息学 组织表达
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 226-239
• 页数: 14页
• 字数: 6067字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.02.0226

摘要

为挖掘果梅中NAC基因成员,探讨其组织表达特异性,本研究采用生物信息学方法鉴定了果梅NAC基因家族,并对其理化性质、染色体分布、亚细胞定位、保守基序、蛋白结构和亚族分类进行预测分析.结果 表明,果梅NAC基因家族包含106个NAC基因成员,根据系统发育特征将其分为12个亚族.PmNAC基因在果梅的8条染色体上呈现不均匀分布,多编码酸性氨基酸;大部分NAC蛋白为亲水蛋白,其二级结构多以无规则卷曲为主要构成元件,且三级结构相似;亚细胞定位预测显示,果梅NAC蛋白为典型的核蛋白.选取12个NAC基因家族成员,利用实时荧光定量PCR技术进行组织表达分析,结果表明,12个果梅NAC基因在不同组织中均有表达,但表达差异明显.其中3个基因(PmNAC54、PmNAC32、PmNAC68)在果皮中表达最高,4个基因(PmNA C60、PmNAC95、PmNA C51、PmNA C2)在果肉中表达最高,3个基因(PmNA C31、PmNAC62、PmNAC48)在嫩茎中表达最高,其余2个基因(PmNAC61和PmNAC71)分别在果胚和花芽中具有最高的表达,表达特征的差异表明它们可能具有不同的生物学功能.本研究结果为果梅NAC蛋白的进一步功能分析奠定了一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高志红	南京农业大学园艺学院	114	1632	21.0	37.0
2	渠慎春	南京农业大学园艺学院	98	858	17.0	25.0
3	侍婷	南京农业大学园艺学院	16	81	5.0	8.0
4	倪照君	南京农业大学园艺学院	14	61	4.0	7.0
5	姚丹	南京农业大学园艺学院	2	8	1.0	2.0
6	倪晓鹏	南京农业大学园艺学院	4	7	1.0	2.0