miRNA在乌鳢水泡病毒感染月鳢细胞(SSN-1)中的表达变化及其调控作用

• 作者: 伊丽竹 徐镇 林蠡 涂加钢
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 乌鳢水泡病毒 SSN-1细胞 miR-100-5p 抗病毒
• 年，卷（期）: 2019,（5）
• 页码范围: 1288-1297
• 页数: 10页
• 分类号: S941.41|Q786
• 字数: 6872字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20171211098

摘要

为了探究microRNA(miRNA)对乌鳢水泡病毒(snakehead vesiculovirus,SHVV)感染月鳢细胞(striped snakehead cell,SSN-1)的影响,本研究对SHVV感染的SSN-1细胞及未感染的细胞进行miRNA高通量测序.分别用U6、β-actin和5S rRNA作为内参基因研究SHVV感染对细胞内22个高丰度(transcripts per million,TPM≥1000)miRNA表达水平的影响,结果显示,U6基因作为内参时,SHVV感染对β-actin没有显著影响,但是5S rRNA显著上调表达,说明U6和β-actin基因适合作为内参基因研究SHVV感染对miRNA表达水平的影响.此外,我们研究了14种miRNA对SHVV增殖的影响.结果发现,miR-27a-3p、miR-26a-5p、miR-30e-3p等11种miRNA显著促进SHVV增殖,miR-150和miR-216b显著抑制SHVV增殖.进一步研究发现高丰度的miR-100-5p在SHVV感染SSN-1细胞早期上调表达,晚期下调表达.过表达miR-100-5p可以显著抑制SHVV的增殖,而抑制表达miR-100-5p可以显著促进SHVV的增殖.本研究为开发抗SHVV的核酸药物提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	涂加钢	华中农业大学水产学院	3	1	1.0	1.0
2	徐镇	华中农业大学水产学院	6	43	3.0	6.0
3	林蠡	华中农业大学水产学院	9	23	2.0	4.0
5	伊丽竹	华中农业大学水产学院	2	1	1.0	1.0