柑橘4CL基因家族的结构及其功能分析

• 作者: 朱世平 王志彬 申晚霞 薛杨 赵婉彤 赵晓春
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柑橘 4CL 生物信息学分析 黄酮 木质素 表达
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1068-1078
• 页数: 11页
• 分类号: S666
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0993

摘要

植物中编码类黄酮和木质素生物合成关键酶,4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)的基因通常是家族基因.通过生物信息分析,从克里曼丁橘(Citrus clementina)基因组数据库中筛选出若干条拟为4CL基因的序列.通过对其蛋白结构进行分析,发现其中仅有3个基因具有典型的4CL家族基因的特性.聚类分析结果表明柑橘Cit4CL1聚到Class Ⅰ,CiHCL2和Cit4CL3聚到ClassⅡ.利用荧光定量PCR(qPCR)对北京柠檬不同组织和发育过程中的果实Cit4CL的表达进行分析,发现各成员的表达存在明显的差异,其中Cit4CL1的表达水平与类黄酮含量呈显著正相关,说明该基因对调控柑橘类黄酮的生物合成具有重要作用.Cit4CL2和CitCL3的表达与类黄酮的含量相关性不显著,但其表达的组织特异性和木质素生物合成较为活跃的组织明显相关,表明这两个基因是与木质素生物合成相关的基因.