利用混池重测序鉴定萨福克绵羊超数排卵关键调控基因

• 作者: 巴提玛 徐照学 施巧婷 曾滔 滑留帅 王二耀 王璟 罗生金 辛晓玲
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 萨福克绵羊 超数排卵 基因组混池 重测序 调控基因
• 年，卷（期）: 2019,（9）
• 所属期刊栏目: 生物技术与繁殖
• 页码范围: 1813-1821
• 页数: 9页
• 分类号: S826.3
• 字数: 6995字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2019.09.008

摘要

旨在对萨福克绵羊超数排卵处理基础上,通过基因组混池重测序鉴定影响超数排卵效果的关键调控基因.本研究对93头年龄在2～3岁之间、健康状况良好的萨福克供体绵羊进行超数排卵处理后,选取超数排卵效果良好(获得的胚胎数大于等于15枚)的30头个体组建高产群体,同时选取超数排卵效果不良(获得的胚胎数小于等于9枚)的30头个体组建低产群体.对2个群体进行基因组混池重测序,并对2个群体中发现的SNPs进行选择消除分析和基因富集分析.结果 表明,超数排卵获得头均总胚胎数为(12.55±7.97)枚,头均可用胚胎数为(7.76±7.43)枚.构建的高产群体和低产群体平均可用胚胎分别为(14.97±8.38)枚和(2.27±2.10)枚.在高产群体和低产群体中分别检出20 189 224和20 396 751个SNPs,对这些SNPs进行选择消除分析和基因富集分析表明,共有11个候选基因能够影响萨福克绵羊超数排卵过程,其中7个基因属于HOXA基因家族,2个基因尚未被验证功能,剩余2个基因分别为DPH6和AKAP6.总体来讲,基于对萨福克绵羊超数排卵高产群体和低产群体的基因组混池重测序,共筛选得到11个关键调控基因,进一步验证HOXA基因家族、DPH6和AKAP6基因在卵泡发育中的作用将有助于解释家畜超数排卵调控机制.