苹果根皮苷-2-O-糖基转移酶基因克隆与表达模式分析

• 作者: 冉军舰 李向阳 梁新红 焦凌霞 赵瑞香 陈晓静
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 工学
• 关键词: 根皮苷 根皮苷-2-O-糖基转移酶 克隆 生物信息学 实时荧光定量聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 203-208
• 页数: 6页
• 分类号: TS255.2
• 字数: 4297字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7506/spkx1002-6630-20180125-328

摘要

目的:根皮苷-2-O-糖基转移酶(phloridzin 2’-O-glycosyltransferase,P2’-GT)是根皮苷合成最后一步关键酶,可以把根皮素转化成根皮苷,本研究在富士苹果中克隆出P2’-GT基因,对基因编码产物进行生物信息学分析和基因的表达模式分析.方法:以苹果皮为材料,提取RNA反转录合成cDNA为模板,设计特异性引物进行扩增和测序,利用Pro Param tool、TMHMM等在线软件对编码蛋白进行生物信息学分析,利用实时荧光定量聚合酶链式反应(realtime fluorescence quatitative polymerase chain reaction,RTFQ-PCR)分析P2’-GTE苹果不同部位、不同苹果品种和不同生长时期的表达差异.结果:P2’-GTcDNA全长1 452 bp,编码483个氨基酸,相对分子质量53.6 kDa,等电点5.76,该基因编码蛋白是不稳定蛋白,不具有明显的跨膜结构,二级结构主要有α-螺旋、无规卷曲和延伸链组成,三级结构结果显示P2’-GT蛋白模型与对苯二酚葡萄糖基转移酶相似度最高(41.32％),进化分析表明P2’-GT与白梨糖基转移酶同源性最高.RTFQ-PCR分析发现P2’-GT在3种苹果皮中均高效表达,在叶和根中微量表达,在果肉中不表达;P2’-GT的转录表达受苹果发育调控,在生长初期几乎不表达,随着苹果发育表达量逐渐增加,在生长中期达到最高值,随后开始减少,至苹果成熟期下降到最高值的50％水平.此外,P2’-GT在3种苹果品种中表达不同,在澳洲青苹中表达量最高,在嘎啦中表达量最低.结论:本研究明确了P2’-GT的生物信息学特性及P2’-GT基因在不同生长期和不同部位的表达差异,为调控根皮苷合成的研究提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李向阳	新乡职业技术学院后勤管理处	9	2	1.0	1.0
2	陈晓静	河南科技学院新科学院	16	42	3.0	6.0