肝癌转移中脂代谢-免疫相关基因的筛选

• 作者: 李保国 王永坤
• 来源期刊: 软件
• 学科: 工学
• 关键词: 肝癌转移 脂代谢 免疫细胞 表达谱
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 设计研究与应用
• 页码范围: 144-150
• 页数: 7页
• 分类号: TP3-05
• 字数: 4160字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-6970.2019.03.029

摘要

肝癌转移是肝癌患者治疗失败和死亡的主要原因,寻找与肝癌发生转移相关的基因对于研究肝癌转移的分子机制,及时诊断、防治肝癌转移具有重要的生物学意义.我们在前期研究中已经发现脂肪代谢可能与免疫微环境存在关联.本研究从GEO数据库下载27例伴有高低转移的肝细胞癌样本的表达谱信息,比较高低转移样本之间基因表达谱的差异,从中筛选出91个脂代谢相关的差异表达基因.通过脂代谢基因的表达谱数据,我们计算了22种免疫细胞在这27例转移样本中的免疫细胞占比,并通过皮尔森相关性分析筛选出脂代谢-免疫相关基因,进一步探究脂代谢与与免疫微环境之间的关系.最后,通过KEGG通路Pathway功能富集分析以及预后分析发现CYP4A11、CYP3A5、CYP2C8、ALDH2、BDH1、ALDH7A1等脂代谢-免疫相关基因可能在肝癌侵袭和转移中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李保国	上海理工大学医疗器械与食品学院	261	1942	19.0	33.0
2	王永坤	上海理工大学医疗器械与食品学院	1	0	0.0	0.0