基于可培养方法分析云南腾冲小空山火山谷芽胞杆菌分布特征

• 作者: 刘国红 刘波 朱育菁 王阶平 车建美 陈倩倩 陈峥
• 来源期刊: 微生物学报
• 关键词: 可培养芽胞杆菌 火山谷 物种多样性
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 极端环境微生物
• 页码范围: 1063-1075
• 页数: 13页
• 语种: 中文
• DOI: 10.13343/j.cnki.wsxb.20180458

摘要

[目的]为了解云南腾冲小空山火山谷土壤中可培养芽胞杆菌种类分布特征.[方法]采用可培养手段对小空山火山谷阳坡、谷底和阴坡土壤中的芽胞杆菌进行分离培养,根据16S rRNA基因序列同源性对分离菌株进行鉴定,并分析系统发育地位.利用Canoc0 5软件分析采样点芽胞杆菌种类分布特征与土壤样品理化性质的相关性.[结果]从火山谷土壤样品中共分离获得180株芽胞杆菌,16S rRNA基因测序鉴定结果表明分离菌株隶属于芽胞杆菌纲2个科(芽胞杆菌科和类芽胞杆菌科)、6个属、34个种,其中芽胞杆菌属(Bacillus) 11个种,类芽胞杆菌属(Paenibacillus) 14个种,短芽胞杆菌属(Brevibacillus)3个种,赖氨酸芽胞杆菌属(Lysinibacillus)4个种,嗜冷芽胞杆菌属(Psychrobacillus)1个种和绿芽胞杆菌属(Viridibacillus)2个种,其中7个菌株与其最近模式菌株16S rRNA相似性低于种的界定阈值(98.65％),为芽胞杆菌潜在新物种.优势属为芽胞杆菌属和类芽胞杆菌属,优势种为蕈状芽胞杆菌(Bacillus mycoides),图瓦永芽胞杆菌(Bacillus toyonensis),蜡状芽胞杆菌(Bacillus cereus),解木糖赖氨酸芽胞杆菌(Lysinibacillus xylanilyticus),蜂房类芽胞杆菌(Paenibacillus alvei)和沙地绿芽胞杆菌(Viridibacillus arenosi).其中16个种分离自阳坡,29个种分离自阴坡,9个种分离自谷底,三者共同种类为6种.阳坡、谷底和阴坡的芽胞杆菌种群分布Bray-Curtis相似性为62.4％,多样性分析结果表明,Shannon指数(H')大小次序为阴坡＞阳坡＞谷底.环境因子分析发现,芽胞杆菌种群分布多样性特征与其土壤的海拔高度、碳氮比和硫含量呈负相关,而和碳源和氮源含量呈正相关.[结论]从以上结果得出,云南腾冲火山谷有着较为丰富的芽胞杆菌资源,且还存在可分离培养的芽胞杆菌的潜在新物种,为利用火山微生物资源提供了保障.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘波	福建省农业科学院农业生物资源所	496	4446	29.0	44.0
2	朱育菁	福建省农业科学院农业生物资源所	235	1678	21.0	29.0
3	车建美	福建省农业科学院农业生物资源所	85	644	14.0	19.0
4	刘国红	福建省农业科学院农业生物资源所	59	363	10.0	16.0
5	陈峥	福建省农业科学院农业生物资源所	86	239	8.0	10.0
6	陈倩倩	福建省农业科学院农业生物资源所	34	112	6.0	7.0
7	王阶平	福建省农业科学院农业生物资源所	32	115	6.0	8.0