布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析

• 作者: 呼和巴特尔 孙柯 王姝懿 王文龙 赵学亮
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 布鲁氏菌 布鲁菌疫苗株A19 全基因组测序 比较基因组学研究
• 年，卷（期）: 2019,（11）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 1002-1008
• 页数: 7页
• 分类号: R378.5
• 字数: 3708字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2019.00.163

摘要

目的 探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究.方法 采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank上的8株菌进行比较基因组学解析.A19基因组3 286 167 bp,预测3 371个基因,GC含量57.25％.通过注释COG库,对应基因有2 560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2 544个基因,共参与33类代谢通路.结果 综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关.结论 通过分析发现,A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因.本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路.