大头鳕TNFSF6基因的结构分析及其在发育早期和病毒暴发时的表达水平

• 作者: 刘瑞婷 姜志强 孙谦 布尔特 毛明光 矫志伟 蒋洁兰 陈明康
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大头鳕 肿瘤坏死因子 TNFSF6 发育 神经坏死病毒
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 页码范围: 523-531
• 页数: 9页
• 分类号: S941.99
• 字数: 5286字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11964/jfc.20171010995

摘要

为揭示大头鳕TNFSF6基因的基本结构与功能及其在大头鳕发育和神经坏死病毒(Pacific cod nervous necrosis virus,PCNNV)暴发时的响应机制,本研究通过基因克隆获得TNFSF6 cDNA开放阅读框序列,并对序列进行生物信息学分析,运用相对荧光定量PCR(qRT-PCR)方法对TNFSF6在不同组织、孵化后不同日龄仔鱼和PCNNV感染前后仔稚鱼中的表达水平进行检测.结果 显示,大头鳕TNFSF6cDNA长1 388 bp,5'UTR占315 bp,3'UTR占500 bp,ORF全长573 bp,编码190个氨基酸.qRT-PCR结果显示,TNFSF6在各组织均有表达,但在脾脏和鳃组织中的表达量较高;大头鳕孵化后15、20、37和40dTNFSF6基因的转录水平分别是其在5d转录水平的0.28、0.15、0.12和0.13倍.在24 d和46 d PCNNV暴发时,病鱼TNFSF6基因的转录水平高于对照组;在77 d PCNNV暴发时,病鱼TNFSF6转录水平则显著低于对照组.研究表明,TNFSF6基因在大头鳕发育早期和仔鱼暴发PCNNV时发挥了重要的作用.