ToCV和TYLCV复合侵染番茄后部分病毒基因序列分析及实时荧光定量PCR分析

• 作者: 周祥明 孙海波 宋建 张越 王姝 范寰 薛俊 金凤媚 陈锐
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄黄化曲叶病毒 番茄褪绿病毒 复合侵染 序列分析 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 95-102
• 页数: 8页
• 分类号: S436.412.1|Q78
• 字数: 5167字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201751035

摘要

番茄褪绿病毒病(ToCV)和番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)存在复合侵染的现象,其发病率逐年递增,成为一种新的威胁番茄产业的病毒病害.为了研究复合侵染样品中2种病毒的互作和基因变异情况,对天津番茄产区发生的TYLCV全基因组和ToCV的CP基因和HSP基因进行了克隆和序列分析.结果表明,与单独侵染样品进行比对,TYLCV的基因序列在复合侵染的样品中共有6处碱基发生了变异,分别为73位A→C、92位A→G、347位C→T、1209位C→T、1618位A→G、2107位A→T,除73位和92位的变异未在编码区,其余的变异碱基均在ORF框内,其中1209位为同义突变,其他均发生了错义突变.ToCV的CP基因有1处同义突变,ToCV的HSP基因共有4处碱基变异,其中826位由T→C和1166位由G→A均为同义突变,1395位和1630位均由A→G,为错义突变.利用实时荧光定量PCR技术对单独侵染和复合侵染的番茄样品中TYLCV和ToCV病毒积累量进行分析.结果表明,在田间单独侵染和复合侵染的样品中,TYLCV的拷贝数差异不显著,ToCV的拷贝数在单独侵染和复合侵染的样品中差异也不显著.在复合侵染的样品中,TYLCV的拷贝数约为ToCV的262～436倍.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	范寰		38	188	7.0	12.0
2	薛俊		31	420	13.0	19.0
3	金凤媚		27	366	12.0	18.0
4	孙海波		35	75	6.0	6.0
5	宋建		14	81	6.0	8.0
6	王姝		25	49	4.0	5.0
7	张越		12	114	6.0	10.0
8	周祥明		7	51	3.0	7.0