通过微阵列数据信息库进行系统筛选并验证宫颈癌中的关键候选基因

• 作者: 何文容 许荣
• 来源期刊: 现代妇产科进展
• 学科: 医学
• 关键词: 差异表达的基因 宫颈癌 生物信息学 验证
• 年，卷（期）: 2019,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 431-433,437
• 页数: 4页
• 分类号: R737.33
• 语种: 中文
• DOI: 10.13283/j.cnki.xdfckjz.2019.06.006

摘要

目的:通过生物信息学方法分析NCBI公共数据库的4个队列数据集,阐明宫颈癌中潜在的关键候选基因和信号通路.方法:筛选差异表达的基因(DEG)并分析候选基因和途径富集.利用在线数据库STRING进行DEG编码的相关蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析.选取宫颈癌和正常组织标本,采用qPCR验证筛选的中枢基因.结果:从4个GSE数据集中鉴定出79个差异基因(69个上调和10个下调).根据功能和信号通路对DEG进行聚类,并进行显著的富集分析.通过PPI网络的整合筛选4个中枢基因RFC4、TOP2 A、PCNA和BUB1.与正常组织相比,癌组织中RFC4、TOP2 A、PCNA和BUB1表达明显升高,差异有统计学意义.结论:使用整合的生物信息学分析,在宫颈癌中鉴定了候选基因和途径,候选基因和相关途径可能是宫颈癌的治疗靶标.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何文容	长江大学附属第一医院妇产科	8	56	3.0	7.0
2	许荣	荆州市中心医院胃肠外科	1	0	0.0	0.0