颅内动脉瘤相关基因的共表达网络构建与分析

• 作者: 周凤坤 周梦晓 周远方 廖宝 秦超 覃燕生 钟松辛
• 来源期刊: 中华医学杂志
• 关键词: 颅内动脉瘤 加权基因共表达网络分析 基因 共表达网络
• 年，卷（期）: 2019,（7）
• 所属期刊栏目: 临床研究
• 页码范围: 525-531
• 页数: 7页
• 字数: 5389字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2019.07.010

摘要

目的 利用生物信息学分析颅内动脉瘤(LA)的公共数据库中的表达谱芯片数据,为疾病机制研究提供重要信息.方法 基于数据集(GSE75436)进行加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建其基因共表达网络,并识别枢纽基因;同时,使用在线工具DAVID对与IA具有高度相关的模块进行GO功能富集及KEGG通路分析.结果 筛选出三个与IA相关的模块,以及识别了棕色模块中的14个枢纽基因COL3A1、SPARC、CDH11、COL5A1、HOPX、CLEC11A、GALNT10、ADAMTS2、CEMIP、KIAA1755、COL11A1、ZIC2、CDKN2A和LINC00460;GO分析显示棕色模块主要富集在细胞外基质组织、胶原蛋白分解代谢过程、细胞黏附等生物过程;KEGG分析显示棕色模块参与了ECM-受体相互作用、局部粘连、蛋白质消化和吸收、PI3K-Akt信号通路等通路.结论 基于WGCNA,我们识别出了对IA发生发展至关重要的模块与枢纽基因,它们可能成为潜在的生物标志物和(或)治疗靶点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦超	广西医科大学第一附属医院神经内科	141	596	12.0	16.0
2	廖宝	广西医科大学第一附属医院神经内科	3	17	2.0	3.0
3	周凤坤	广西医科大学第一附属医院神经内科	1	3	1.0	1.0
4	钟松辛	广西医科大学第一附属医院神经内科	1	3	1.0	1.0
5	周远方	广西医科大学第一附属医院神经内科	3	18	2.0	3.0
6	覃燕生	广西医科大学第一附属医院神经内科	1	3	1.0	1.0
7	周梦晓	广西医科大学第一附属医院神经内科	2	3	1.0	1.0