辣椒Whirly基因家族的鉴定及表达分析

• 作者: 原玉香 吕艳艳 姚秋菊 姜俊 张强 张晓伟 张梦园 李艳 杨双娟 王志勇 赵艳艳 郑小兰 魏小春
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 辣椒 Whirly基因家族 全基因组鉴定 胁迫 表达分析
• 年，卷（期）: 2019,（2）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·生物技术
• 页码范围: 72-78
• 页数: 7页
• 分类号: S641.03|Q78
• 字数: 3835字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.201750777

摘要

为了探索辣椒Whirly基因家族成员的功能和进化关系,通过生物信息学分析了其基因结构、保守基序、进化关系及表达模式,通过荧光定量PCR测定其在脱落酸、高温、低温、疫病等胁迫下的表达量.结果表明,从辣椒CM334中鉴定了2个Whirly基因家族成员,CaWHY1和CaWHY2.辣椒CaWHY1和CaWHY2同其他物种Whirly基因理化性质相比,差别不大,结构相似性高,CaWHY2基因和番茄的SlWHY2基因结构完全一样,在系统进化树中聚在一起.CaWHY1与SlWHY1聚在一起,但它们的基因结构不同,说明Whirly蛋白在进化过程中,结构保守.表达模式分析发现,CaWHY1和CaWHY2在辣椒CM334中均能表达,但在不同组织和果实发育时期的表达水平存在差异.CaWHY1和CaWHY2在不同胁迫处理下受到不同程度的诱导,其中CaWHY1明显受疫病的诱导,CaWHY2在低温处理和脱落酸胁迫下的表达量变化趋势相反.由此可知,Whirly基因家族在辣椒的生长发育中起调控作用,在各种逆境胁迫中也发挥一定作用.