梅山猪线粒体基因组全序列测定与分析

• 作者: 丁威 吴井生 唐文 李定国 杨剑波 秦虎 蒯冬灵 邢军 陈军
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 梅山猪 线粒体基因组 D-loop
• 年，卷（期）: 2019,（12）
• 所属期刊栏目: 遗传繁育
• 页码范围: 9-14
• 页数: 6页
• 分类号: S828.8+1
• 字数: 3624字
• 语种: 中文

摘要

采用PCR测序技术对梅山猪线粒体基因组进行测序,并对其特征进行分析.结果 表明,梅山猪线粒体基因组序列全长16 730 bp,包含13个蛋白编码基因,2个rRNA,22个tRNA和1个非编码控制区(D-loop);蛋白编码基因起始密码子分别为ATA(ND2、ND3和ND5),GTG(ND4L),剩余均为ATG,终止密码子分别为TAG(ND1、ND2)、AGA(CrtB)、TAA(COX1、ATP8、ATP6、ND4L、ND5和ND6),其余为不完全密码子T;22个tRNA中除tRNA-Ser (AGY)缺少DHU臂外,其余tRNA均可形成典型三叶草结构;线粒体控制区全长1 294 bp,包括26个串联重复序列(CGTGCGTACA),以及TAS-3、TAS、OH、CSB-1、CSB-2、CSB-3和LSP等保守框.采用MEGA X最大似然法基于线粒体全序列构建进化树,梅山猪(小型)与陆川猪最为相近.