基于转录组信息的黑果枸杞WD40蛋白质家族分析

• 作者: 严莉 乔改霞 仝倩 李健 王晨 王翠平 陈建伟
• 来源期刊: 核农学报
• 关键词: 黑果枸杞 转录组测序 WD40蛋白 分层聚类分析 表达模式
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 植物诱变育种·农业生物技术
• 页码范围: 482-489
• 页数: 8页
• 字数: 5295字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.03.0482

摘要

WD40蛋白质为真核生物中一种常见蛋白质,广泛参与植物生长发育的多种生物过程,在蛋白质-蛋白质及蛋白质-DNA的相互作用中发挥重要作用.为系统分析黑果枸杞WD40蛋白质家族成员,本研究以黑果枸杞青色期、转色期和成熟期3个发育时期的果实转录组测序数据为基础,结合Nr、Nt、Pfam、KOG/COG、Swiss-prot、KEGG及G0 7个数据库和NCBI网站,对黑果枸杞WD40蛋白质编码基因进行筛选注释.结果 表明,共得到77个黑果枸杞WD40蛋白质家族成员,黑果枸杞WD40蛋白质结构域组成多样,且在不同物种间高度保守;亚细胞定位预测分析表明,黑果枸杞WD40蛋白质家族成员多位于细胞核及细胞质中;黑果枸杞和拟南芥WD40蛋白质共建的系统进化树可分为五个亚家族;WD40蛋白质家族成员编码基因随果实发育的表达模式表明,黑果枸杞WD40蛋白质家族成员可能参与了其果实花青素的变化调控.本研究结果为枸杞WD40蛋白质的分离及功能研究奠定了一定的理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	乔改霞	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	8	28	3.0	5.0
2	王晨	宁夏大学生命科学学院	3	1	1.0	1.0
3	仝倩	宁夏大学生命科学学院	4	11	1.0	3.0
4	王翠平	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	11	26	3.0	5.0
5	陈建伟	宁夏林业研究院种苗生物工程国家重点实验室	8	26	3.0	5.0
6	严莉	宁夏大学生命科学学院	6	58	4.0	6.0